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| 1.Runde | 2.Runde | Achtelfinale | |
| Viertelfinale | Halbfinale | ||
| Finale | |||
| 1.Runde | ||
| Club Atletico Madrid - SV Werder Bremen | 2:0 | 1:2n.V. |
| Kalmar FF - Bayer 04 Leverkusen | 1:4 | 0:3 |
| FC Bayer 05 Uerdingen - FC Carl Zeiss Jena | 3:0 | 4:0 |
| Borussia Mönchengladbach - FK Partizan Belgrad | 1:0 | 3:1 |
| Athletic Club Bilbao - 1. FC Magdeburg | 2:0 | 0:1 |
| FC Coleraine - EFC Stahl Brandenburg | 1:1 | 0:1 |
| RC Lens - FC Dundee United | 1:0 | 0:2 |
| FC Groningen - Galway United | 5:1 | 3:1 |
| IA Akranes - Sporting CP Lissabon | 0:9 | 0:6 |
| AS Jeunesse Esch - AA Gent | 1:2 | 1:1 |
| Pecsi MSC - Feyenoord Rotterdam | 1:0 | 0:2 |
| AC Sparta Prag - Vitoria Guimaraes | 1:1 | 1:2 |
| Heart of Midlothian FC - ASVS Dukla Prag | 3:2 | 0:1 |
| FC Nantes - Turin Calcio | 0:4 | 1:1 |
| FK Dinamo Minsk - Györi ETO FC | 2:4 | 1:0 |
| KP Legia Warschau SSA - Dnepr Dnepropetrovsk | 0:0 | 1:0 |
| Sigma Olomouc - IFK Göteborg | 1:1 | 0:4 |
| FC Glasgow Rangers - Ilves Tampere | 4:0 | 0:2 |
| Linzer ASK - Widzew Lodz | 1:1 | 0:1 |
| Neuchâtel Xamax - Lyngby BK | 2:0 | 3:1 |
| SK Beveren - Valerengens IF | 1:0 | 0:0 |
| OFI Iraklion - NK Hajduk Split | 1:0 | 0:4 |
| KS Flamurtari Vlore - FC Barcelona | 1:1 | 0:0 |
| AC Florenz - FC Boavista Porto | 1:0 |
0:1n.V. 1:3i.E. |
| Hibernians Paola - FC Trakia Plovdiv | 0:2 | 0:8 |
| FC Swarovski Tirol Innsbruck - FK Sredez Sofia | 3:0* | 0:2 |
| Sportul Studentesc - Omonia Nicosia | 1:0 | 1:1 |
| FC Universitatea Craiova - Galatasaray SK | 2:0 | 1:2 |
| FC Inter Mailand - AEK Athen | 2:0 | 1:0 |
| NK Rijeka - Standard Lüttich | 0:1 | 1:1 |
| SSC Neapel - FC Toulouse | 1:0 |
0:1n.V. 3:4i.E. |
| FC Spartak Moskau - FC Luzern | 0:0 | 1:0 |
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| 2.Runde | ||
| Borussia Mönchengladbach - Feyenoord Rotterdam | 5:1 | 2:0 |
| Widzew Lodz - FC Bayer 05 Uerdingen | 0:0 | 0:2 |
| ASVS Dukla Prag - Bayer 04 Leverkusen | 0:0 | 1:1 |
| IFK Göteborg - BSG Stahl Brandenburg | 2:0 | 1:1 |
| FC Groningen - Neuchâtel Xamax | 0:0 | 1:1 |
| SK Beveren - Athletic Club Bilbao | 3:1 | 1:2 |
| FC Glasgow Rangers - FC Boavista Porto | 2:1 | 1:0 |
| KP Legia Warschau SSA - FC Inter Mailand | 3:2 | 0:1 |
| Vitoria Guimaraes - Club Atletico Madrid | 2:0 | 0:1 |
| Sportul Studentesc - AA Gent | 0:3 | 1:1 |
| Turin Calcio - Györi ETO FC | 4:0 | 1:1 |
| FC Barcelona - Sporting CP Lissabon | 1:0 | 1:2 |
| NK Hajduk Split - FC Trakia Plovdiv | 3:1 | 2:2 |
| FC Swarovski Tirol Innsbruck - Standard Lüttich | 2:1 | 2:3 |
| FC Toulouse - FC Spartak Moskau | 3:1 | 1:5 |
| FC Dundee United - FC Universitatea Craiova | 3:0 | 0:1 |
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| Achtelfinale | ||
| FC Bayer 05 Uerdingen - FC Barcelona | 0:2 | 0:2 |
| FC Glasgow Rangers - Borussia Mönchengladbach | 1:1 | 0:0 |
| FC Spartak Moskau - FC Swarovski Tirol Innsbruck | 1:0 | 0:2 |
| ASVS Dukla Prag - FC Inter Mailand | 0:1 | 0:0* |
| Turin Calcio - SK Beveren | 2:1 | 1:0 |
| FC Groningen - Vitoria Guimaraes | 1:0 | 0:3 |
| AA Gent - IFK Göteborg | 0:1 | 0:4 |
| FC Dundee United - NK Hajduk Split | 2:0 | 0:0 |
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| Viertelfinale | ||
| Borussia Mönchengladbach - Vitoria Guimaraes | 3:0 | 2:2 |
| FC Dundee United - FC Barcelona | 1:0 | 2:1 |
| Turin Calcio - FC Swarovski Tirol Innsbruck | 0:0 | 1:2 |
| IFK Göteburg - FC Inter Mailand | 0:0 | 1:1 |
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| Halbfinale | ||
| FC Dundee United - Borussia Mönchengladbach | 0:0 | 2:0 |
| IFK Göteborg - FC Swarovski Tirol Innsbruck | 4:1 | 1:0 |
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| Finale am 06. und 20.05.1987 | ||
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IFK Göteborg - FC Dundee United |
1:0 | 1:1 |
Hinweise:
1.Runde:
* Das Hinspiel wurde nach
35 Minuten beim Stand von 0:1 wegen
starken Regens abgebrochen, das Ergebnis wurde annulliert und das
Spiel am darauf folgenden Tag wiederholt.
Achtelfinale:
* Spiel wurde wegen starken Nebels nach 77
Minuten abgebrochen,
aber trotzdem gewertet.